Die Begräbniskirche Santa Maria zählt zu den kostbarsten sakralen Bauten im Kanton Graubünden. Sie enthält kostbare mittelalterliche Wandmalereien mit byzantinisch-romanischen Fragmenten von hoher Qualität aus dem 13. Jh. und einen erzählfreudigen lombardischen Zyklus von 1495. Nach ihrer Vergrösserung 1495 wurde die Kirche vollständig neu ausgemalt, auch über die alten Fresken hinweg. An der Westwand und am Turm legte man bei der Restaurierung von 1962 bis 1976 einen Maria-Magdalena-Zyklus in 18 Bildern frei.

Die Kirche Sta. Maria - heute Begräbniskapelle von Pontresina - ist im Besitz der politischen Gemeinde Pontresina. Hier werden auch Andachten gehalten. Das Kirchlein ist zudem sehr beliebt zum Heiraten und zieht Paare aus aller Welt an.